微孔草耐寒，耐旱，喜强光照。生长于高寒草甸、林地、灌丛和次生植被中，常与1年生作物或1-2年生野生植物混合生长形成植物群落。这些群落与环境之间未达到平衡，处于不稳定状态，群落内部物种成分常发生变化。随原有种的消失，新物种的入侵，微孔草的数量逐步减少，有时从群落中消失。微孔草在植物群落中通常不是优势种，其优势度处在7%-15%。它作为次生演替初始阶段植被成员而占据有效空间，成为高山地区次生植被中的生态适宜种而生存。